Dr.Explain permite trabajar al mismo tiempo en varios proyectos diferentes. Es posible abrir todos los proyectos en una única instancia de Dr.Explain o bien abrir cada uno en instancias independientes de Dr.Explain.
Para cambiar de un proyecto a otro, puede utilizar el método abreviado del teclado Ctrl+TAB (si los proyectos se han abierto en una única instancia de Dr.Explain) o el método abreviado del teclado Alt+TAB (si los proyectos se han abierto en múltiples instancias de Dr.Explain).
En caso de que se hayan abierto varios proyectos en una única instancia de Dr.Explain, dichos proyectos se pueden mostrar en bloque o en cascada, dependiendo de la opción del menú Ventanas seleccionada.